60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1731 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1731  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  944    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00706224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3322  hypothetical protein  29.2 
 
 		 429 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01230  Na+/melibiose symporter-like transporter  28.79 
 
 		 435 aa  147  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1592  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 435 aa  142  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.241693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1203  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  0.147172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  25.61 
 
 		 500 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  24.2 
 
 		 552 aa  53.5  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  24.21 
 
 		 448 aa  53.1  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  25.75 
 
 		 495 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  25.65 
 
 		 527 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  22.34 
 
 		 500 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  25.88 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  23.48 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  23.48 
 
 		 500 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  25.72 
 
 		 496 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  25.72 
 
 		 496 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 489 aa  52  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  25 
 
 		 452 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  27.91 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  26.82 
 
 		 503 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 495 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  26.05 
 
 		 503 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  27.49 
 
 		 491 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  26.21 
 
 		 483 aa  50.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  22.18 
 
 		 500 aa  50.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  22.46 
 
 		 500 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  26.02 
 
 		 485 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  26.02 
 
 		 485 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  25.89 
 
 		 489 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  25.44 
 
 		 489 aa  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  26.21 
 
 		 485 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  25.44 
 
 		 489 aa  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  26.21 
 
 		 485 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  26.21 
 
 		 485 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  26.21 
 
 		 485 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  21.88 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  21.88 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  21.88 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  21.88 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  26.21 
 
 		 485 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  25.91 
 
 		 531 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  24.22 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  25.81 
 
 		 485 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  25.81 
 
 		 485 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  25 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  24.91 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  24.91 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  21.28 
 
 		 501 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1596  putative proline/betaine transporter  25.82 
 
 		 628 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  25.26 
 
 		 534 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  24.91 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  24.91 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  25.26 
 
 		 534 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  20.99 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  20.99 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 389 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  25.36 
 
 		 626 aa  43.9  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32150  arabinose efflux permease family protein  23.43 
 
 		 467 aa  43.1  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  19.88 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>