23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2938 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2938  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  140  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4622  hypothetical protein  35.29 
 
 
74 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1522  hypothetical protein  41.38 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1788  conserved hypothetical protein, CF-27 family  36.21 
 
 
69 aa  50.1  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000754484  hitchhiker  0.00694105 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1610  hypothetical protein  37.1 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.27133e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2956  hypothetical protein  40.35 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2639  hypothetical protein  40.35 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1071  Domain of unknown function DUF1858  42.59 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.8935500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2496  hypothetical protein  37.04 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00868558  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1108  hypothetical protein  37.5 
 
 
64 aa  47  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2247  hypothetical protein  37.31 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1939  hypothetical protein  38.6 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0695  hypothetical protein  34.48 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2522  hypothetical protein  34.92 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000234668  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2353  hypothetical protein  34.33 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1241  hypothetical protein  30.65 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3946  hypothetical protein  30.51 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000136439  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1011  hypothetical protein  35.59 
 
 
73 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0443  hypothetical protein  33.9 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3092  hypothetical protein  30.51 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000117757  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0180  hypothetical protein  35.38 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353427  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4076  Domain of unknown function DUF1858  30.51 
 
 
65 aa  40.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000134682  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4278  hypothetical protein  33.87 
 
 
88 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>