38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1241 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1241  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1758  hypothetical protein  71.88 
 
 		 64 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0622082  normal  0.113278 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1767  hypothetical protein  72.88 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2502  hypothetical protein  60.94 
 
 		 64 aa  88.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000507516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2188  hypothetical protein  65.08 
 
 		 63 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.503021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2319  hypothetical protein  57.41 
 
 		 59 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1890  hypothetical protein  56.14 
 
 		 59 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0695  hypothetical protein  42.62 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1108  hypothetical protein  41.94 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1939  hypothetical protein  43.55 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1788  conserved hypothetical protein, CF-27 family  42.37 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000754484  hitchhiker  0.00694105 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2639  hypothetical protein  44.07 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2956  hypothetical protein  44.07 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1071  Domain of unknown function DUF1858  37.5 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.8935500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2496  hypothetical protein  37.29 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00868558  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2306  hypothetical protein  35.59 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1610  hypothetical protein  40.98 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.27133e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1902  hypothetical protein  33.9 
 
 		 64 aa  52  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00826077  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2846  hydroxylamine reductase  37.93 
 
 		 621 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4076  Domain of unknown function DUF1858  34.38 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000134682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1866  hypothetical protein  37.93 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2077  hypothetical protein  40.98 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000111793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2522  hypothetical protein  37.1 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000234668  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1262  Domain of unknown function DUF1858  41.94 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000513804  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0399  hypothetical protein  40.68 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.455844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1278  hypothetical protein  39.66 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0238912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1535  hypothetical protein  36.51 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3092  hypothetical protein  36.07 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000117757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2420  hypothetical protein  31.15 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330689  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2353  hypothetical protein  31.58 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0922  hypothetical protein  42.62 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00558419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1776  hypothetical protein  34.48 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000548631  normal  0.0470683 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1671  hypothetical protein  33.33 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0162434  hitchhiker  0.000000000876812 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2938  hypothetical protein  30.65 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0443  hypothetical protein  27.59 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1011  hypothetical protein  27.27 
 
 		 73 aa  42  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2812  hypothetical protein  34.48 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00427131  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0025  hypothetical protein  27.59 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.293859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>