29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1890 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1890  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2319  hypothetical protein  98.31 
 
 
59 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2502  hypothetical protein  66.67 
 
 
64 aa  87  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000507516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2188  hypothetical protein  57.89 
 
 
63 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.503021  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1758  hypothetical protein  61.11 
 
 
64 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0622082  normal  0.113278 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1241  hypothetical protein  56.14 
 
 
67 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1767  hypothetical protein  59.26 
 
 
66 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2496  hypothetical protein  46.3 
 
 
68 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00868558  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1939  hypothetical protein  50.85 
 
 
64 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1071  Domain of unknown function DUF1858  40 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.8935500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0695  hypothetical protein  44.44 
 
 
65 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1108  hypothetical protein  41.38 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2522  hypothetical protein  44.44 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000234668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1788  conserved hypothetical protein, CF-27 family  46.3 
 
 
69 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000754484  hitchhiker  0.00694105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2077  hypothetical protein  43.1 
 
 
69 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000111793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1610  hypothetical protein  42.11 
 
 
68 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.27133e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2306  hypothetical protein  31.48 
 
 
64 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1902  hypothetical protein  31.48 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00826077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1278  hypothetical protein  36.36 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0238912  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1776  hypothetical protein  37.04 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000548631  normal  0.0470683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1011  hypothetical protein  34.69 
 
 
73 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2353  hypothetical protein  35.85 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2639  hypothetical protein  35.19 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2956  hypothetical protein  35.19 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1866  hypothetical protein  29.63 
 
 
65 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168119  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2247  hypothetical protein  33.9 
 
 
95 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0922  hypothetical protein  40.48 
 
 
80 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00558419  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1262  Domain of unknown function DUF1858  31.58 
 
 
69 aa  41.6  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000513804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2846  hydroxylamine reductase  38.46 
 
 
621 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>