23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2247 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2247  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  193  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4278  hypothetical protein  51.61 
 
 
88 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3946  hypothetical protein  48.44 
 
 
65 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000136439  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4622  hypothetical protein  46.88 
 
 
74 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6823  hypothetical protein  56 
 
 
51 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595623  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1522  hypothetical protein  43.1 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0325  hypothetical protein  44.23 
 
 
68 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.727355  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1970  hypothetical protein  44.23 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1610  hypothetical protein  33.9 
 
 
68 aa  51.2  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.27133e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0969  hypothetical protein  51.11 
 
 
68 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1788  conserved hypothetical protein, CF-27 family  40 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000754484  hitchhiker  0.00694105 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2938  hypothetical protein  37.31 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2522  hypothetical protein  33.33 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000234668  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1011  hypothetical protein  33.96 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0399  hypothetical protein  36.36 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.455844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4076  Domain of unknown function DUF1858  28.57 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000134682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2319  hypothetical protein  33.9 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2846  hydroxylamine reductase  32.14 
 
 
621 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2353  hypothetical protein  34.33 
 
 
64 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1890  hypothetical protein  33.9 
 
 
59 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0695  hypothetical protein  29.31 
 
 
65 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2639  hypothetical protein  35.38 
 
 
63 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2956  hypothetical protein  35.38 
 
 
63 aa  40  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>