26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4622 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4622  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3946  hypothetical protein  54.69 
 
 		 65 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000136439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2247  hypothetical protein  46.88 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4278  hypothetical protein  49.18 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6823  hypothetical protein  58 
 
 		 51 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1522  hypothetical protein  49.15 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0969  hypothetical protein  51.02 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1011  hypothetical protein  44.44 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2938  hypothetical protein  35.29 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0325  hypothetical protein  44.23 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.727355  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1970  hypothetical protein  47.92 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1939  hypothetical protein  33.33 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2496  hypothetical protein  31.82 
 
 		 68 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00868558  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1262  Domain of unknown function DUF1858  23.08 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000513804  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4076  Domain of unknown function DUF1858  30.65 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000134682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2420  hypothetical protein  31.58 
 
 		 67 aa  47.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3092  hypothetical protein  28.36 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000117757  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1071  Domain of unknown function DUF1858  29.31 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.8935500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1610  hypothetical protein  24.19 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.27133e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1788  conserved hypothetical protein, CF-27 family  28.33 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000754484  hitchhiker  0.00694105 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0695  hypothetical protein  27.42 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2188  hypothetical protein  27.42 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.503021  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2639  hypothetical protein  28.81 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1535  hypothetical protein  34.38 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000642921  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2956  hypothetical protein  28.81 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1108  hypothetical protein  25.4 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>