26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4278 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4278  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2247  hypothetical protein  51.61 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3946  hypothetical protein  50.79 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000136439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4622  hypothetical protein  49.18 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1522  hypothetical protein  51.92 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1011  hypothetical protein  44.07 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0325  hypothetical protein  46.15 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.727355  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1970  hypothetical protein  46.15 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6823  hypothetical protein  60 
 
 		 51 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0969  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4076  Domain of unknown function DUF1858  33.33 
 
 		 65 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000134682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0695  hypothetical protein  36.21 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1788  conserved hypothetical protein, CF-27 family  33.87 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000754484  hitchhiker  0.00694105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1767  hypothetical protein  41.38 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2496  hypothetical protein  31.67 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00868558  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2522  hypothetical protein  38.98 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000234668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1108  hypothetical protein  31.67 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1071  Domain of unknown function DUF1858  29.09 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.8935500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2502  hypothetical protein  36.21 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000507516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3024  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  38 
 
 		 294 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2077  hypothetical protein  39.66 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000111793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1610  hypothetical protein  29.31 
 
 		 68 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.27133e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0584  hypothetical protein  32.65 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2639  hypothetical protein  36.96 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2956  hypothetical protein  36.96 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2938  hypothetical protein  33.87 
 
 		 69 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>