26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1522 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1522  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  154  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4622  hypothetical protein  49.15 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4278  hypothetical protein  51.92 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3946  hypothetical protein  47.06 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000136439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2247  hypothetical protein  43.1 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6823  hypothetical protein  48.94 
 
 		 51 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2938  hypothetical protein  41.38 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0325  hypothetical protein  43.14 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.727355  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1970  hypothetical protein  43.14 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2846  hydroxylamine reductase  31.03 
 
 		 621 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1011  hypothetical protein  38.98 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1535  hypothetical protein  37.93 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0969  hypothetical protein  43.14 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1788  conserved hypothetical protein, CF-27 family  33.33 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000754484  hitchhiker  0.00694105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4076  Domain of unknown function DUF1858  37.04 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000134682  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1767  hypothetical protein  37.93 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2496  hypothetical protein  31.48 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00868558  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1610  hypothetical protein  38.1 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.27133e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1071  Domain of unknown function DUF1858  27.59 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.8935500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2522  hypothetical protein  36.73 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000234668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0695  hypothetical protein  36.73 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2353  hypothetical protein  31.58 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0025  hypothetical protein  29.82 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1939  hypothetical protein  31.03 
 
 		 64 aa  41.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1108  hypothetical protein  28.85 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2420  hypothetical protein  28.3 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>