43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2522 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2522  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000234668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1776  hypothetical protein  66.13 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000548631  normal  0.0470683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1278  hypothetical protein  62.9 
 
 
65 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0238912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2306  hypothetical protein  61.02 
 
 
64 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1902  hypothetical protein  61.02 
 
 
64 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00826077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1866  hypothetical protein  58.06 
 
 
65 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2077  hypothetical protein  54.84 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000111793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1610  hypothetical protein  55.38 
 
 
68 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.27133e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1939  hypothetical protein  55.74 
 
 
64 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1108  hypothetical protein  49.18 
 
 
64 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2496  hypothetical protein  51.72 
 
 
68 aa  70.5  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00868558  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0695  hypothetical protein  46.03 
 
 
65 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1071  Domain of unknown function DUF1858  50.77 
 
 
66 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.8935500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1788  conserved hypothetical protein, CF-27 family  43.55 
 
 
69 aa  63.5  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000754484  hitchhiker  0.00694105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2188  hypothetical protein  40.32 
 
 
63 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.503021  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2956  hypothetical protein  44.07 
 
 
63 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2639  hypothetical protein  44.07 
 
 
63 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1758  hypothetical protein  42.62 
 
 
64 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0622082  normal  0.113278 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0922  hypothetical protein  48.39 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00558419  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2319  hypothetical protein  42.11 
 
 
59 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2502  hypothetical protein  39.34 
 
 
64 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000507516  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1890  hypothetical protein  44.44 
 
 
59 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1767  hypothetical protein  40.98 
 
 
66 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2812  hypothetical protein  35.59 
 
 
70 aa  53.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00427131  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0180  hypothetical protein  41.94 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353427  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2846  hydroxylamine reductase  39.34 
 
 
621 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0399  hypothetical protein  37.29 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.455844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1262  Domain of unknown function DUF1858  37.7 
 
 
69 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000513804  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0025  hypothetical protein  39.66 
 
 
63 aa  50.8  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1241  hypothetical protein  37.1 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4076  Domain of unknown function DUF1858  37.1 
 
 
65 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000134682  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2353  hypothetical protein  37.1 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0584  hypothetical protein  30.65 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3753  hypothetical protein  40.68 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000020937  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4278  hypothetical protein  38.98 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3092  hypothetical protein  36.67 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000117757  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2247  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0443  hypothetical protein  32.76 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2938  hypothetical protein  34.92 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1671  hypothetical protein  36.84 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0162434  hitchhiker  0.000000000876812 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1522  hypothetical protein  36.73 
 
 
75 aa  43.5  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2420  hypothetical protein  32.2 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330689  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1535  hypothetical protein  33.33 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000642921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>