19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6823 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6823  hypothetical protein  100 
 
 		 51 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3946  hypothetical protein  65.31 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000136439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4622  hypothetical protein  58 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2247  hypothetical protein  56 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1522  hypothetical protein  48.94 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4278  hypothetical protein  60 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0969  hypothetical protein  55.56 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1011  hypothetical protein  48.84 
 
 		 73 aa  50.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1610  hypothetical protein  40.91 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.27133e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2353  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1788  conserved hypothetical protein, CF-27 family  37.5 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000754484  hitchhiker  0.00694105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4076  Domain of unknown function DUF1858  33.33 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000134682  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0325  hypothetical protein  48.72 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.727355  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1970  hypothetical protein  54.29 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0399  hypothetical protein  37.78 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.455844  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1939  hypothetical protein  39.13 
 
 		 64 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0025  hypothetical protein  35.42 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2420  hypothetical protein  38.1 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2496  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00868558  normal  0.165471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>