28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3946 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3946  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  135  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000136439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4622  hypothetical protein  54.69 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2247  hypothetical protein  48.44 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4278  hypothetical protein  50.79 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6823  hypothetical protein  65.31 
 
 		 51 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4076  Domain of unknown function DUF1858  38.71 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000134682  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1522  hypothetical protein  47.06 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0969  hypothetical protein  59.09 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0325  hypothetical protein  44.23 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.727355  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1970  hypothetical protein  44.23 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1011  hypothetical protein  48.84 
 
 		 73 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1939  hypothetical protein  34.43 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1788  conserved hypothetical protein, CF-27 family  36.84 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000754484  hitchhiker  0.00694105 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1610  hypothetical protein  31.15 
 
 		 68 aa  50.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.27133e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2496  hypothetical protein  32.76 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00868558  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2639  hypothetical protein  33.33 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2956  hypothetical protein  33.33 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1262  Domain of unknown function DUF1858  26.32 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000513804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2420  hypothetical protein  31.03 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2846  hydroxylamine reductase  28.81 
 
 		 621 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2353  hypothetical protein  30.51 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3092  hypothetical protein  33.9 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000117757  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3753  hypothetical protein  36.07 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000020937  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0025  hypothetical protein  32.2 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2938  hypothetical protein  30.51 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0399  hypothetical protein  31.58 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.455844  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1535  hypothetical protein  34.48 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0584  hypothetical protein  27.45 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>