36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3753 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3753  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000020937  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3092  hypothetical protein  60.61 
 
 
68 aa  92  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000117757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2420  hypothetical protein  55.38 
 
 
67 aa  90.1  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330689  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1535  hypothetical protein  58.46 
 
 
72 aa  88.2  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000642921  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2846  hydroxylamine reductase  58.33 
 
 
621 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0399  hypothetical protein  61.02 
 
 
75 aa  70.5  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.455844  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1788  conserved hypothetical protein, CF-27 family  45.76 
 
 
69 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000754484  hitchhiker  0.00694105 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2956  hypothetical protein  49.18 
 
 
63 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2639  hypothetical protein  49.18 
 
 
63 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1108  hypothetical protein  48.28 
 
 
64 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1866  hypothetical protein  40.98 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168119  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4076  Domain of unknown function DUF1858  46.55 
 
 
65 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000134682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2306  hypothetical protein  44.07 
 
 
64 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2496  hypothetical protein  41.38 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00868558  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1902  hypothetical protein  44.07 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00826077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0695  hypothetical protein  44.07 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1776  hypothetical protein  41.67 
 
 
66 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000548631  normal  0.0470683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1610  hypothetical protein  41.67 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.27133e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0025  hypothetical protein  45 
 
 
63 aa  54.7  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1939  hypothetical protein  41.38 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1262  Domain of unknown function DUF1858  40.91 
 
 
69 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000513804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1278  hypothetical protein  37.7 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0238912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3024  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.82 
 
 
294 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1671  hypothetical protein  43.33 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0162434  hitchhiker  0.000000000876812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2522  hypothetical protein  40.68 
 
 
66 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000234668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1071  Domain of unknown function DUF1858  38.46 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.8935500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3946  hypothetical protein  36.07 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000136439  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1241  hypothetical protein  37.93 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2353  hypothetical protein  33.33 
 
 
64 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0443  hypothetical protein  33.33 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2077  hypothetical protein  35 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000111793  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0180  hypothetical protein  36.21 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353427  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2188  hypothetical protein  37.93 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.503021  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4622  hypothetical protein  30 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1767  hypothetical protein  37.93 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1758  hypothetical protein  37.93 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0622082  normal  0.113278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>