39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1902 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1902  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  134  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00826077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2306  hypothetical protein  96.88 
 
 		 64 aa  131  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1866  hypothetical protein  79.37 
 
 		 65 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1776  hypothetical protein  67.21 
 
 		 66 aa  96.7  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000548631  normal  0.0470683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1278  hypothetical protein  63.93 
 
 		 65 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0238912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2522  hypothetical protein  61.02 
 
 		 66 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000234668  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2077  hypothetical protein  48.33 
 
 		 69 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000111793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2496  hypothetical protein  42.86 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00868558  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0695  hypothetical protein  41.27 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1610  hypothetical protein  45 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.27133e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1939  hypothetical protein  43.33 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2956  hypothetical protein  41.67 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2639  hypothetical protein  41.67 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1108  hypothetical protein  39.66 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1788  conserved hypothetical protein, CF-27 family  36.51 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000754484  hitchhiker  0.00694105 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2812  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00427131  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2420  hypothetical protein  35.94 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3753  hypothetical protein  44.07 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000020937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1071  Domain of unknown function DUF1858  46 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.8935500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2846  hydroxylamine reductase  32.2 
 
 		 621 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2353  hypothetical protein  35.09 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3092  hypothetical protein  35.48 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000117757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1535  hypothetical protein  34.38 
 
 		 72 aa  52.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000642921  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4076  Domain of unknown function DUF1858  36.07 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000134682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1241  hypothetical protein  33.9 
 
 		 67 aa  52  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1262  Domain of unknown function DUF1858  34.38 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000513804  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0399  hypothetical protein  31.67 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.455844  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1767  hypothetical protein  33.9 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0025  hypothetical protein  36.21 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0443  hypothetical protein  31.03 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0922  hypothetical protein  39.58 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00558419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2502  hypothetical protein  30 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000507516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2188  hypothetical protein  30.51 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.503021  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1758  hypothetical protein  31.67 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0622082  normal  0.113278 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0180  hypothetical protein  31.58 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0584  hypothetical protein  33.87 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1671  hypothetical protein  33.96 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0162434  hitchhiker  0.000000000876812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1890  hypothetical protein  31.48 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2319  hypothetical protein  31.48 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>