34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1671 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1671  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0162434  hitchhiker  0.000000000876812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2353  hypothetical protein  77.05 
 
 
64 aa  97.4  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0025  hypothetical protein  65.57 
 
 
63 aa  87  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0180  hypothetical protein  64.41 
 
 
64 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353427  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0443  hypothetical protein  57.38 
 
 
63 aa  77.8  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2639  hypothetical protein  50.88 
 
 
63 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2956  hypothetical protein  50.88 
 
 
63 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2846  hydroxylamine reductase  54.39 
 
 
621 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1108  hypothetical protein  43.1 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0695  hypothetical protein  38.6 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1788  conserved hypothetical protein, CF-27 family  41.38 
 
 
69 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000754484  hitchhiker  0.00694105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4076  Domain of unknown function DUF1858  42.11 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000134682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1776  hypothetical protein  36.84 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000548631  normal  0.0470683 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1071  Domain of unknown function DUF1858  39.22 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.8935500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1278  hypothetical protein  36.84 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0238912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1939  hypothetical protein  36.84 
 
 
64 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1902  hypothetical protein  33.96 
 
 
64 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00826077  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0399  hypothetical protein  39.66 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.455844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2306  hypothetical protein  33.96 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3092  hypothetical protein  42.37 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000117757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2496  hypothetical protein  36.84 
 
 
68 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00868558  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1758  hypothetical protein  34.48 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0622082  normal  0.113278 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1610  hypothetical protein  35.09 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.27133e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1866  hypothetical protein  28.07 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2077  hypothetical protein  39.62 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000111793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2522  hypothetical protein  36.84 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000234668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3024  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.55 
 
 
294 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1535  hypothetical protein  40.35 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000642921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1241  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2188  hypothetical protein  32.76 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.503021  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0922  hypothetical protein  42.86 
 
 
80 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00558419  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3753  hypothetical protein  54.55 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000020937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2502  hypothetical protein  27.59 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000507516  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1767  hypothetical protein  32.76 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>