32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0180 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0180  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353427  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0025  hypothetical protein  77.05 
 
 
63 aa  99.8  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2353  hypothetical protein  70.49 
 
 
64 aa  94  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0443  hypothetical protein  65 
 
 
63 aa  83.6  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1671  hypothetical protein  64.41 
 
 
61 aa  77.8  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0162434  hitchhiker  0.000000000876812 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2956  hypothetical protein  48.28 
 
 
63 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2639  hypothetical protein  48.28 
 
 
63 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1108  hypothetical protein  46.03 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2846  hydroxylamine reductase  42.37 
 
 
621 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2522  hypothetical protein  41.94 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000234668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1776  hypothetical protein  39.34 
 
 
66 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000548631  normal  0.0470683 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1788  conserved hypothetical protein, CF-27 family  41.38 
 
 
69 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000754484  hitchhiker  0.00694105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1071  Domain of unknown function DUF1858  37.93 
 
 
66 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.8935500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1610  hypothetical protein  35.48 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.27133e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2306  hypothetical protein  33.33 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2496  hypothetical protein  38.6 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00868558  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1902  hypothetical protein  31.58 
 
 
64 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00826077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0695  hypothetical protein  32.79 
 
 
65 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2812  hypothetical protein  37.25 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00427131  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1939  hypothetical protein  36.84 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0399  hypothetical protein  37.93 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.455844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1866  hypothetical protein  33.33 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168119  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2420  hypothetical protein  34.43 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1278  hypothetical protein  33.33 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0238912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0922  hypothetical protein  40.43 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00558419  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1535  hypothetical protein  34.43 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0584  hypothetical protein  37.78 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1262  Domain of unknown function DUF1858  32.56 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000513804  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2938  hypothetical protein  35.38 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4076  Domain of unknown function DUF1858  32.76 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000134682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3024  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.58 
 
 
294 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2077  hypothetical protein  35.71 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000111793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>