15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0968 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0968  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  805    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0116  hypothetical protein  35.46 
 
 
407 aa  216  4e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000692452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1074  hypothetical protein  33.78 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2589  hypothetical protein  33.77 
 
 
396 aa  199  9e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3187  hypothetical protein  33.7 
 
 
397 aa  192  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2858  hypothetical protein  31.07 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.953596  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0501  hypothetical protein  30.62 
 
 
402 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3747  hypothetical protein  29.25 
 
 
396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.652201  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0051  hypothetical protein  28.68 
 
 
399 aa  149  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000151873  hitchhiker  0.00624496 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4047  hypothetical protein  32.57 
 
 
388 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3702  hypothetical protein  30.7 
 
 
403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2870  hypothetical protein  28.49 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0451  hypothetical protein  28.76 
 
 
377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3430  hypothetical protein  25.81 
 
 
480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1829  hypothetical protein  23.67 
 
 
388 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>