15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3702 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3702  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  827    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0501  hypothetical protein  64.95 
 
 		 402 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4047  hypothetical protein  64.95 
 
 		 388 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0451  hypothetical protein  51.5 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1074  hypothetical protein  36.29 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2858  hypothetical protein  32.27 
 
 		 394 aa  212  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.953596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3187  hypothetical protein  36.29 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0116  hypothetical protein  32.72 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000692452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0968  hypothetical protein  28.35 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2589  hypothetical protein  28.49 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3430  hypothetical protein  27.27 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3747  hypothetical protein  24.93 
 
 		 396 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.652201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0051  hypothetical protein  24.61 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000151873  hitchhiker  0.00624496 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1829  hypothetical protein  23.68 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2870  hypothetical protein  24.53 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>