15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0501 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0501  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  828    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4047  hypothetical protein  84.28 
 
 		 388 aa  679    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3702  hypothetical protein  65.53 
 
 		 403 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0451  hypothetical protein  50.67 
 
 		 377 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1074  hypothetical protein  37.02 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3187  hypothetical protein  36.76 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2858  hypothetical protein  29.49 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.953596  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0116  hypothetical protein  33.5 
 
 		 407 aa  189  9e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000692452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0968  hypothetical protein  30.62 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2589  hypothetical protein  29.77 
 
 		 396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3747  hypothetical protein  24.94 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.652201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0051  hypothetical protein  25.87 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000151873  hitchhiker  0.00624496 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3430  hypothetical protein  25.44 
 
 		 480 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1829  hypothetical protein  24.61 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2870  hypothetical protein  22.43 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>