15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_B3747 on replicon NC_007349
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007349  Mbar_B3747  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  814    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.652201  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0051  hypothetical protein  59.03 
 
 
399 aa  503  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000151873  hitchhiker  0.00624496 
 
 
-
 
NC_002950  PG0116  hypothetical protein  29.32 
 
 
407 aa  170  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000692452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1074  hypothetical protein  28.24 
 
 
397 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2858  hypothetical protein  31.15 
 
 
394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.953596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3187  hypothetical protein  29.07 
 
 
397 aa  159  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0968  hypothetical protein  29.25 
 
 
385 aa  153  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2589  hypothetical protein  25.97 
 
 
396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1829  hypothetical protein  28.98 
 
 
388 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3430  hypothetical protein  23.71 
 
 
480 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0501  hypothetical protein  24.94 
 
 
402 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0451  hypothetical protein  24.93 
 
 
377 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4047  hypothetical protein  25 
 
 
388 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3702  hypothetical protein  25.07 
 
 
403 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2870  hypothetical protein  20.57 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>