15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2589 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2589  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  821    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2870  hypothetical protein  36.49 
 
 
401 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0116  hypothetical protein  35.9 
 
 
407 aa  240  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000692452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1074  hypothetical protein  37.34 
 
 
397 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3187  hypothetical protein  37.22 
 
 
397 aa  229  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2858  hypothetical protein  33.33 
 
 
394 aa  209  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.953596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0968  hypothetical protein  33.77 
 
 
385 aa  199  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0451  hypothetical protein  32.89 
 
 
377 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3747  hypothetical protein  25.97 
 
 
396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.652201  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4047  hypothetical protein  30.63 
 
 
388 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0501  hypothetical protein  29.77 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3702  hypothetical protein  28.18 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0051  hypothetical protein  27.41 
 
 
399 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000151873  hitchhiker  0.00624496 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3430  hypothetical protein  25.5 
 
 
480 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1829  hypothetical protein  26.03 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>