More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0702 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0702  ABC transporter related  100 
 
 
252 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.48 
 
 
251 aa  310  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  58.73 
 
 
252 aa  307  8e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  57.26 
 
 
249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.06 
 
 
253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.47 
 
 
251 aa  299  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.82 
 
 
255 aa  298  6e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  57.49 
 
 
285 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.82 
 
 
276 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_002936  DET0141  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  55.02 
 
 
251 aa  296  3e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0229  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  54.22 
 
 
251 aa  294  8e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.27 
 
 
251 aa  294  9e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1602  phosphate transporter ATP-binding protein  55.24 
 
 
249 aa  294  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00468848  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  53.23 
 
 
253 aa  293  2e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  53.41 
 
 
258 aa  293  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004378  phosphate transport ATP-binding protein PstB  56.68 
 
 
272 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  55.47 
 
 
285 aa  293  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2396  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  56.05 
 
 
283 aa  293  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  56.28 
 
 
272 aa  292  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  59.24 
 
 
277 aa  291  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_149  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 
251 aa  291  7e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  56.45 
 
 
252 aa  291  7e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  56.28 
 
 
272 aa  290  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  53.6 
 
 
252 aa  290  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1376  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  54.62 
 
 
260 aa  290  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  55.47 
 
 
272 aa  290  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01033  phosphate transporter ATP-binding protein  56.28 
 
 
272 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 
277 aa  288  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  55.47 
 
 
272 aa  288  7e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  55.47 
 
 
272 aa  288  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0260  phosphate transporter ATP-binding protein  56.68 
 
 
273 aa  287  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 
277 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 
272 aa  286  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  56.68 
 
 
281 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  52.21 
 
 
273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1670  ABC transporter related  53.63 
 
 
253 aa  285  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000049572  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 
272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 
272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  55.47 
 
 
272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 
272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  56.68 
 
 
277 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5038  phosphate transporter ATP-binding protein  58.4 
 
 
277 aa  285  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268746  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 
272 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 
272 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 
272 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  56.68 
 
 
277 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1410  phosphate transporter ATP-binding protein  55.47 
 
 
272 aa  285  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.261593  normal  0.0224304 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 
272 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5612  phosphate transporter ATP-binding protein  56.68 
 
 
277 aa  285  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8399  normal  0.188753 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  53.57 
 
 
252 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1725  phosphate transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 
264 aa  285  7e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  52.21 
 
 
254 aa  285  7e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1436  phosphate transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 
272 aa  284  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4289  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  53.23 
 
 
249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  51.81 
 
 
251 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  55.24 
 
 
253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  55.65 
 
 
256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  56.72 
 
 
284 aa  283  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2521  phosphate ABC transporter ATPase subunit  53.78 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0748442  normal  0.186434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0539  phosphate ABC transporter permease  53.04 
 
 
272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2548  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  56 
 
 
292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  53.82 
 
 
275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 
261 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1487  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  53.23 
 
 
293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0256969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0658  phosphate transporter ATP-binding protein  51.81 
 
 
260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  51.82 
 
 
267 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000180282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4154  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  53.36 
 
 
272 aa  282  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.914841  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  54.44 
 
 
252 aa  281  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0498  phosphate ABC transporter permease  51.19 
 
 
254 aa  281  7.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0483  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 
269 aa  280  1e-74  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00884783  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0653  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  52.57 
 
 
282 aa  280  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  54.44 
 
 
253 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0607  phosphate transporter ATP-binding protein  54.44 
 
 
253 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.080383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  53.23 
 
 
262 aa  280  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0379  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  52.57 
 
 
254 aa  280  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.198087  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0586  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  54.1 
 
 
272 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.518906 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  53.44 
 
 
249 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3821  ABC-type phosphate transporter, ATP-binding protein  51.61 
 
 
249 aa  280  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  51.21 
 
 
251 aa  280  2e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  52.63 
 
 
258 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3118  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  52.61 
 
 
291 aa  279  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0430987  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0622  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  54.03 
 
 
269 aa  279  3e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.970932  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1617  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  52.42 
 
 
284 aa  279  3e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336518  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  53.69 
 
 
267 aa  279  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3640  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  54.29 
 
 
279 aa  279  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.720751  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0946  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  53.94 
 
 
287 aa  279  4e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.754172 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  52.82 
 
 
262 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1236  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  51.81 
 
 
286 aa  278  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.534632  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  54.44 
 
 
251 aa  278  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  53.23 
 
 
255 aa  278  7e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0823  phosphate transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 
260 aa  278  7e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511308 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  52.42 
 
 
262 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001265  phosphate transport ATP-binding protein PstB  53.23 
 
 
249 aa  278  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0486  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 
251 aa  277  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1307  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  51.21 
 
 
260 aa  277  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.390273 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  50.81 
 
 
251 aa  277  1e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0066  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  53.17 
 
 
251 aa  277  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0711697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1666  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  53.36 
 
 
265 aa  277  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000112485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>