More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1194 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1194  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  100 
 
 
138 aa  285  2e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0105452  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4504  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  50.39 
 
 
144 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.150463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1422  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  49.61 
 
 
142 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0967  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  48.84 
 
 
144 aa  147  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0599586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0067  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  47.73 
 
 
332 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3192  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  47.29 
 
 
146 aa  144  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1882  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  44.96 
 
 
149 aa  137  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.430184  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0673  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.52 
 
 
146 aa  116  9e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2588  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  40.94 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2651  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  40.77 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1622  ech hydrogenase subunit C  40.15 
 
 
144 aa  108  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1070  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.28 
 
 
142 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2726  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  35.82 
 
 
147 aa  106  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0851861  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0957  membrane bound hydrogenase subunit mbhJ  40.16 
 
 
143 aa  105  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0013552  normal  0.515096 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4116  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  40.94 
 
 
338 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.890746  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1084  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  37.31 
 
 
154 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00491903  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1671  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  37.98 
 
 
185 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2503  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  39.53 
 
 
157 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1520  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  38.76 
 
 
157 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0324  putative hydrogenase/oxidoreductase subunit  43.31 
 
 
177 aa  103  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02381  hydrogenase 4, Fe-S subunit  40.58 
 
 
252 aa  103  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1180  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  40.58 
 
 
252 aa  103  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3711  hydrogenase-4, I subunit  40.58 
 
 
252 aa  103  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2861  hydrogenase-4, I subunit  40.58 
 
 
252 aa  103  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2623  hydrogenase-4, I subunit  40.58 
 
 
252 aa  103  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1187  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  40.58 
 
 
252 aa  103  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.274215 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2636  hydrogenase-4, I subunit  40.58 
 
 
252 aa  103  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2771  hydrogenase-4, I subunit  40.58 
 
 
252 aa  103  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02343  hypothetical protein  40.58 
 
 
252 aa  103  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02534  hypothetical protein  41.73 
 
 
255 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02569  hydrogenase 3 and formate hydrogenase complex, HycG subunit  41.73 
 
 
255 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0970  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  41.73 
 
 
255 aa  102  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3970  formate hydrogenlyase, subunit G  41.73 
 
 
255 aa  102  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2968  formate hydrogenlyase, subunit G  41.73 
 
 
255 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3034  formate hydrogenlyase subunit G  41.73 
 
 
255 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679196 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2999  formate hydrogenlyase subunit G  41.73 
 
 
255 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2844  formate hydrogenlyase, subunit G  41.73 
 
 
255 aa  102  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0598328 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3050  formate hydrogenlyase subunit G  41.73 
 
 
255 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0362  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  34.85 
 
 
160 aa  102  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.547425  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3157  formate hydrogenlyase, subunit G  41.73 
 
 
255 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102122 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0993  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  41.73 
 
 
255 aa  102  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0465314 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2855  formate hydrogenlyase, subunit G  41.73 
 
 
255 aa  102  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3007  formate hydrogenlyase, subunit G  41.73 
 
 
255 aa  102  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0370  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  42.74 
 
 
153 aa  102  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.898351  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3192  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  41.73 
 
 
255 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0713  hydrogenase-4 component I  39.1 
 
 
274 aa  101  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0121746  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0026  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  35.04 
 
 
163 aa  101  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1637  hypothetical protein  39.1 
 
 
274 aa  101  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019853  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0174  putative hydrogenase/oxidoreductase subunit  40.15 
 
 
175 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2783  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  37.8 
 
 
179 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2791  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  37.8 
 
 
179 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0125  hydrogenase-Ni,Fe-hydrogenase III small subunit  40.74 
 
 
271 aa  100  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0706  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  41.03 
 
 
156 aa  100  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01010  Ni,Fe-hydrogenase III small subunit  39.29 
 
 
283 aa  99.4  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1868  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  40.46 
 
 
274 aa  99.4  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3060  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  40 
 
 
166 aa  99.8  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471144  normal  0.336978 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0117  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  40.17 
 
 
156 aa  99.4  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.729725  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1212  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  40.17 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0321  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  36.92 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0772  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  40.87 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1612  putative hydrogenase subunit  40.31 
 
 
172 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4568  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  41.3 
 
 
246 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1732  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  35.66 
 
 
144 aa  98.6  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00966661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2715  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  39.86 
 
 
263 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1278  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  39.57 
 
 
263 aa  99  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499713  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1527  putative hydrogenase subunit  40.31 
 
 
172 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3022  ech hydrogenase subunit C  35.66 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.678569  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1743  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  35.04 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1266  formate hydrogenlyase subunit 7  39.39 
 
 
174 aa  97.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0551  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  39.37 
 
 
143 aa  97.8  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2229  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  35.77 
 
 
183 aa  97.8  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0705013  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0571  hypothetical protein  38.24 
 
 
159 aa  97.4  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111186  decreased coverage  0.000343935 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6070  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  39.37 
 
 
176 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2184  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  40 
 
 
252 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.245512 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13360  ech hydrogenase subunit C  34.85 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2428  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  40.74 
 
 
265 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.674115  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2104  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  36.07 
 
 
150 aa  94.4  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07240  ech hydrogenase subunit C  37.98 
 
 
181 aa  94.4  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0105522  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1572  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  35.61 
 
 
147 aa  93.6  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.105543 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3369  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  37.7 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0593  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  38.84 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0796  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  37.3 
 
 
236 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0921  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  37.12 
 
 
181 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1686  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  39.52 
 
 
266 aa  92  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1132  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  35.54 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0931  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  33.59 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0869  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  34.35 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0118885 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1183  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  33.58 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.853539  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2154  hydrogenase-4, I subunit  36.51 
 
 
165 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.5376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1812  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  36.51 
 
 
165 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.718239  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0150  ech hydrogenase subunit C  34.43 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2455  ech hydrogenase subunit C  32.56 
 
 
163 aa  90.5  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0152532  normal  0.126862 
 
 
-
 
NC_002936  DET0862  hydrogenase, group 4, EchC subunit, putative  37.7 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3850  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  37.9 
 
 
177 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100692  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_765  hydrogenase, EchC subunit  37.7 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1359  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  36.64 
 
 
146 aa  90.1  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1100  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  39.66 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.878145  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1787  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  32.82 
 
 
147 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0181  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  37.31 
 
 
245 aa  89  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.419402  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4666  hydrogenase 4 subunit I  35.07 
 
 
171 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>