13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1821 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1821  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 304 aa  617  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4341  hypothetical protein  50.17 
 
 		 302 aa  298  6e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0497  hypothetical protein  41.64 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5160  hypothetical protein  25.48 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.651921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3157  hypothetical protein  25.55 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1616  hypothetical protein  24.83 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.977694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2656  hypothetical protein  26.88 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0856  hypothetical protein  28.82 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1997  hypothetical protein  22.97 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2407  hypothetical protein  23.72 
 
 		 227 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000243807  normal  0.0667541 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0870  hypothetical protein  22.92 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1587  hypothetical protein  40 
 
 		 311 aa  45.8  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1529  hypothetical protein  40 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>