13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3157 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3157  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5160  hypothetical protein  28.43 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.651921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1997  hypothetical protein  24.61 
 
 		 325 aa  99.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1821  response regulator receiver domain-containing protein  25.55 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4341  hypothetical protein  24.27 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0497  hypothetical protein  25.87 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1616  hypothetical protein  22.22 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.977694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2656  hypothetical protein  24.36 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0995  hypothetical protein  26.44 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1587  hypothetical protein  45 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1529  hypothetical protein  45 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318828  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0326  abortive lactococcal phage infection protein, N-terminal region  32.2 
 
 		 91 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0870  hypothetical protein  39.34 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>