13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5160 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5160  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.651921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3157  hypothetical protein  28.43 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1997  hypothetical protein  26.42 
 
 		 325 aa  92.4  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4341  hypothetical protein  25.67 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1821  response regulator receiver domain-containing protein  25.48 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2656  hypothetical protein  25.17 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0497  hypothetical protein  22.92 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1616  hypothetical protein  21 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.977694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0870  hypothetical protein  24.42 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0995  hypothetical protein  23.03 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2407  hypothetical protein  20.88 
 
 		 227 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000243807  normal  0.0667541 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0326  abortive lactococcal phage infection protein, N-terminal region  33.33 
 
 		 91 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0856  hypothetical protein  20.98 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321973 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>