12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4341 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4341  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  616  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1821  response regulator receiver domain-containing protein  50.17 
 
 		 304 aa  298  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0497  hypothetical protein  42.67 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5160  hypothetical protein  25.67 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.651921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3157  hypothetical protein  24.27 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1616  hypothetical protein  23.81 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.977694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2407  hypothetical protein  25.84 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000243807  normal  0.0667541 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2656  hypothetical protein  25.09 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0856  hypothetical protein  25.16 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1997  hypothetical protein  23.88 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0870  hypothetical protein  22.13 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0326  abortive lactococcal phage infection protein, N-terminal region  40.82 
 
 		 91 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>