16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0870 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0870  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  607  1e-173  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0995  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0326  abortive lactococcal phage infection protein, N-terminal region  50 
 
 		 91 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1587  hypothetical protein  24.83 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1529  hypothetical protein  24.83 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318828  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1997  hypothetical protein  22.18 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_002950  PG0856  hypothetical protein  24.61 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1821  response regulator receiver domain-containing protein  22.92 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5160  hypothetical protein  24.42 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.651921 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2893  hypothetical protein  22.11 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395748  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1616  hypothetical protein  28 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.977694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2656  hypothetical protein  26.98 
 
 		 304 aa  45.8  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3157  hypothetical protein  39.34 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4341  hypothetical protein  22.13 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0497  hypothetical protein  21.96 
 
 		 303 aa  42.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2407  hypothetical protein  37.93 
 
 		 227 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000243807  normal  0.0667541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>