92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4920 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04252  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.397505  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04218  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.313842  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3622  protein of unknown function DUF1328  100 
 
 		 53 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4920  hypothetical protein  100 
 
 		 53 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.96102  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5889  hypothetical protein  100 
 
 		 53 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.299473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4924  hypothetical protein  100 
 
 		 53 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3680  hypothetical protein  100 
 
 		 53 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.208944  hitchhiker  0.0015276 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4974  hypothetical protein  100 
 
 		 53 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00473249  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4611  hypothetical protein  100 
 
 		 53 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.288809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4918  hypothetical protein  98.11 
 
 		 53 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4970  hypothetical protein  98.11 
 
 		 53 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4816  hypothetical protein  98.11 
 
 		 53 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4883  hypothetical protein  98.11 
 
 		 53 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.071393  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4977  hypothetical protein  98.11 
 
 		 53 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.078056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0553  hypothetical protein  98.11 
 
 		 53 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.386711  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0654  hypothetical protein  92.45 
 
 		 85 aa  90.1  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.450723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0536  hypothetical protein  90.57 
 
 		 53 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.217472  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0835  hypothetical protein  88.46 
 
 		 53 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0455  hypothetical protein  96.23 
 
 		 53 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.483164  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  61.54 
 
 		 53 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3502  hypothetical protein  90.38 
 
 		 53 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3631  hypothetical protein  90.38 
 
 		 53 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  64.15 
 
 		 54 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0044  hypothetical protein  60.78 
 
 		 54 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0151  hypothetical protein  57.69 
 
 		 53 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843759 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3862  hypothetical protein  65.38 
 
 		 58 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0419  protein of unknown function DUF1328  61.11 
 
 		 56 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4171  protein of unknown function DUF1328  65.38 
 
 		 58 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0153  hypothetical protein  57.69 
 
 		 53 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  62.75 
 
 		 52 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0135  hypothetical protein  57.69 
 
 		 53 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5092  hypothetical protein  57.69 
 
 		 53 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00404445  normal  0.354219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4322  protein of unknown function DUF1328  65.38 
 
 		 58 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3464  protein of unknown function DUF1328  63.46 
 
 		 53 aa  57  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5993  hypothetical protein  65.22 
 
 		 54 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5876  hypothetical protein  65.38 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0484  hypothetical protein  59.26 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1725  hypothetical protein  57.69 
 
 		 57 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327274  normal  0.493212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6731  protein of unknown function DUF1328  58.7 
 
 		 55 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2772  hypothetical protein  58.49 
 
 		 55 aa  54.3  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.773202  normal  0.17509 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0991  hypothetical protein  51.92 
 
 		 52 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0179922  hitchhiker  0.000000000000845091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4397  protein of unknown function DUF1328  53.85 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.522854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2727  hypothetical protein  53.85 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  53.85 
 
 		 55 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  60.87 
 
 		 56 aa  50.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2738  hypothetical protein  53.57 
 
 		 57 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0245  protein of unknown function DUF1328  51.92 
 
 		 57 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1842  hypothetical protein  53.85 
 
 		 53 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000526578 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0130  hypothetical protein  54.9 
 
 		 51 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2202  hypothetical protein  54.9 
 
 		 51 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0139  hypothetical protein  54.9 
 
 		 51 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5991  protein of unknown function DUF1328  47.17 
 
 		 54 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3366  hypothetical protein  48.08 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467157  hitchhiker  0.00768256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3278  hypothetical protein  53.85 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.759532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0270  hypothetical protein  54.72 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2024  hypothetical protein  51.92 
 
 		 57 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418321  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2359  hypothetical protein  51.92 
 
 		 57 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.329968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  48.08 
 
 		 54 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  48.15 
 
 		 58 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2720  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0172  hypothetical protein  51.92 
 
 		 51 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1245  hypothetical protein  47.17 
 
 		 54 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01748  hypothetical protein  55.1 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  52.17 
 
 		 57 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2080  hypothetical protein  51.92 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4110  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1698  hypothetical protein  48.08 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3474  protein of unknown function DUF1328  45.1 
 
 		 54 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0482  hypothetical protein  61.11 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  46.94 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72370  hypothetical protein  61.54 
 
 		 53 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.160327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6280  hypothetical protein  61.54 
 
 		 53 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03948  hypothetical protein  53.19 
 
 		 52 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1861  protein of unknown function DUF1328  41.51 
 
 		 54 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0562518  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2788  hypothetical protein  49.09 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0124  hypothetical protein  48.15 
 
 		 54 aa  42  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594475  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0879  hypothetical protein  51.02 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.60509  normal  0.363431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3864  hypothetical protein  53.33 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.231517  normal  0.991686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2834  hypothetical protein  51.11 
 
 		 54 aa  41.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.397287  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6383  protein of unknown function DUF1328  63.46 
 
 		 58 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3511  hypothetical protein  51.11 
 
 		 54 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0920  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2901  hypothetical protein  69.7 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1875  hypothetical protein  46.3 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4137  hypothetical protein  58.82 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.320678  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0070  hypothetical protein  61.54 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.842765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3129  protein of unknown function DUF1328  57.69 
 
 		 58 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998737  normal  0.804441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2903  hypothetical protein  57.69 
 
 		 58 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5006  hypothetical protein  57.69 
 
 		 58 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0555285  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3027  protein of unknown function DUF1328  57.69 
 
 		 58 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.171842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0263  hypothetical protein  41.07 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2238  hypothetical protein  44.44 
 
 		 55 aa  40  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>