287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2061 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00024  IS1 protein InsB  91.74 
 
 		 504 bp  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00213822  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0802  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00237  IS1 protein InsB  91.74 
 
 		 504 bp  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0604  IS1 transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0749  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00503    91.29 
 
 		 1860 bp  993    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.233499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00504  IS1 protein InsB  91.74 
 
 		 504 bp  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00545  IS1 protein insB  91.74 
 
 		 504 bp  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.160638  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0560  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 504 bp  999    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00131966  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1065  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01115    91.1 
 
 		 1689 bp  975    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0546  IS1 transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01242    91.36 
 
 		 2672 bp  991    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01244  IS1 protein InsA  91.74 
 
 		 504 bp  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01373  IS1 protein InsB  91.74 
 
 		 504 bp  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01771  predicted transporter  98.97 
 
 		 1446 bp  2585    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01881  IS1 protein InsB  91.74 
 
 		 504 bp  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000653204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0706  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.60614  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0534    99.61 
 
 		 2436 bp  1499    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02143  IS1 protein InsB  91.74 
 
 		 504 bp  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0997  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000390214  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02450    91.25 
 
 		 2195 bp  987    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02452  IS1 protein InsB  91.74 
 
 		 504 bp  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0975  IS1 transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00027943  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02645    91.12 
 
 		 1425 bp  979    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04179  hypothetical protein  91.74 
 
 		 504 bp  642    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1082  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03226    91.23 
 
 		 1863 bp  983    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0964  IS1 transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0119708  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03483    91.12 
 
 		 1673 bp  979    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0466  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.634009  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04161    99.24 
 
 		 396 bp  761    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0558  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0461  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0651  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  983    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.332966  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04214    91.38 
 
 		 2201 bp  995    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.611997  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0917  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00131212  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04286  IS1 protein InsB  91.74 
 
 		 504 bp  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.448136  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0271    90.92 
 
 		 698 bp  876    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1842  choline/carnitine/betaine transporter  99.04 
 
 		 1431 bp  2593    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.220871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2655    91.07 
 
 		 698 bp  884    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3331    91.07 
 
 		 698 bp  884    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.526792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3341    91.07 
 
 		 698 bp  884    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.720184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3576    91.07 
 
 		 698 bp  884    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000806307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3685    91.07 
 
 		 698 bp  884    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.406239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3706    99.14 
 
 		 698 bp  1336    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3780    91.07 
 
 		 698 bp  884    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0909  IS1 transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00244451  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0048    98.36 
 
 		 504 bp  904    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0333  IS1, transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0134876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1163  IS1, transposase orfB  91.74 
 
 		 504 bp  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.452867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1889  putative transporter  98.9 
 
 		 1611 bp  2577    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2176  IS1, transposase orfB  98.21 
 
 		 498 bp  930    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0703398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2198  IS1, transposase orfB  92.06 
 
 		 504 bp  682    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2655  IS1, transposase orfB  91.74 
 
 		 504 bp  642    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000283913  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2027  putative transporter  98.9 
 
 		 1611 bp  2577    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.12575  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4872    99.4 
 
 		 504 bp  975    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4941    97.42 
 
 		 503 bp  888    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3802    90.79 
 
 		 698 bp  854    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0270  insertion element protein  95.56 
 
 		 698 bp  1138    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0507177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0746    99.43 
 
 		 698 bp  1352    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0855  insertion element protein  95.56 
 
 		 698 bp  1138    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0978  insertion element protein  95.56 
 
 		 698 bp  1138    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1570  insertion element protein  95.56 
 
 		 698 bp  1138    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54283  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1612  insertion element protein  95.56 
 
 		 698 bp  1138    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1815    94.95 
 
 		 1749 bp  1223    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.488582  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1816  insertion element protein  95.56 
 
 		 698 bp  1138    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.495778 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1832  putative transporter  98.97 
 
 		 1446 bp  2585    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.301874 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2200  insertion element protein  95.56 
 
 		 698 bp  1138    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2454  insertion element protein  95.56 
 
 		 698 bp  1138    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2713    95.16 
 
 		 3054 bp  1221    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2714  insertion element protein  95.56 
 
 		 698 bp  1138    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2872  insertion element protein  91.93 
 
 		 698 bp  932    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0170965  normal  0.0593155 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2883  insertion element protein  95.56 
 
 		 698 bp  1138    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00013028  normal  0.0546907 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3170  insertion element protein  91.07 
 
 		 698 bp  884    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3171  insertion element protein  99.28 
 
 		 698 bp  1344    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.22651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3185  insertion element protein  99.28 
 
 		 698 bp  1344    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3346  insertion element protein  95.42 
 
 		 698 bp  1130    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3632  insertion element protein  95.56 
 
 		 698 bp  1138    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00026173  normal  0.763989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3881  insertion element protein  95.56 
 
 		 698 bp  1138    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.719771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3893  insertion element protein  95.42 
 
 		 698 bp  1130    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0818  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.449545  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0636  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.527887  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0086  IS1 transposase orfB  91.74 
 
 		 504 bp  642    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0718475  hitchhiker  0.0000000542412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0557  IS1 transposase orfB  95.29 
 
 		 504 bp  785    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1030  IS1 transposase orfB  91.74 
 
 		 504 bp  642    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.871892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1387  putative transporter  97.35 
 
 		 1611 bp  2411    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.216138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0413  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0444  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000536612  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4757  IS1 transposase orfB  97.22 
 
 		 504 bp  888    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.279139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0014  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0676781  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0038  IS1 transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0101  IS1 transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0130  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000385847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0214  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.672743  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0221  IS1 transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0330  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183379  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0260  IS1 transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0270  IS1 transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0281  IS1 transposase orfB  92 
 
 		 504 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>