290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03483 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00024  IS1 protein InsB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00213822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00211  IS1 protein InsB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00237  IS1 protein InsB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00313  IS1 protein InsB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00340  IS1 protein InsB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00503    99.74 
 
 		 1860 bp  1507    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.233499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00504  IS1 protein InsB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00545  IS1 protein insB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.160638  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00571  IS1 protein InsB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00587  IS1 protein InsB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01115    100 
 
 		 1689 bp  1522    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01117  IS1 protein InsB  100 
 
 		 504 bp  999    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01242    99.74 
 
 		 2672 bp  1509    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01244  IS1 protein InsA  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01373  IS1 protein InsB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01881  IS1 protein InsB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000653204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01934  IS1 protein InsB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02040  IS1 protein InsB  100 
 
 		 504 bp  999    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02143  IS1 protein InsB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02270  IS1 protein InsB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02450    99.87 
 
 		 2195 bp  1520    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02452  IS1 protein InsB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02514  IS1 protein InsB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02645    100 
 
 		 1425 bp  1528    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02646  IS1 protein InsB  100 
 
 		 504 bp  999    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02823  IS1 protein InsB  100 
 
 		 504 bp  999    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000374053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03226    99.87 
 
 		 1863 bp  1516    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03227  IS1 protein InsB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03483    100 
 
 		 1673 bp  3316    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03484  IS1 protein InsB  100 
 
 		 504 bp  999    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04163  IS1 protein InsB  100 
 
 		 504 bp  999    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.636696  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04180  IS1 protein InsB  100 
 
 		 504 bp  999    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04209  IS1 protein InsB  100 
 
 		 504 bp  999    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04214    99.74 
 
 		 2201 bp  1513    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.611997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04281  IS1 protein InsB  100 
 
 		 504 bp  999    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04286  IS1 protein InsB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.448136  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0271    99.86 
 
 		 698 bp  1376    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2655    98.85 
 
 		 698 bp  1320    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3331    98.71 
 
 		 698 bp  1312    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.526792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3341    98.71 
 
 		 698 bp  1312    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.720184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3576    100 
 
 		 698 bp  1384    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000806307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3685    100 
 
 		 698 bp  1384    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.406239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3706    90.49 
 
 		 698 bp  852    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3780    100 
 
 		 698 bp  1384    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4691  hypothetical protein  100 
 
 		 504 bp  999    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000333815  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0065  IS1, transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343111  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0048    92.8 
 
 		 504 bp  706    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0333  IS1, transposase orfB  91.8 
 
 		 504 bp  650    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0134876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0739  IS1, transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00024765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0780  IS1, transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1140  IS1, transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0049533  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1163  IS1, transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.452867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1386  IS1, transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1530  IS1, transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1651  IS1, transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000315416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1779  IS1, transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1900  IS1, transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2416  IS1, transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0295227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2650  IS1, transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0337075  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2655  IS1, transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000283913  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2701  IS1, transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2761  IS1, transposase orfB  99.8 
 
 		 504 bp  991    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000020143  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2785  IS1, transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000643973  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2922  IS1, transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129263  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3007  IS1, transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000875521  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3091  IS1, transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3145  IS1, transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3240  IS1, transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.035564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3688  IS1, transposase orfB  99.6 
 
 		 504 bp  983    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3837  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  98.61 
 
 		 996 bp  946    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000031402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0330  IS1, transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3316  IS1, transposase orfB  99.01 
 
 		 504 bp  959    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4129  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  99.8 
 
 		 996 bp  993    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0229706  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4913  IS1, transposase orfB  97.82 
 
 		 495 bp  920    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4941    92.36 
 
 		 503 bp  658    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3802    99.71 
 
 		 698 bp  1354    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0083  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  98.61 
 
 		 996 bp  946    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  hitchhiker  0.00261992 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0270  insertion element protein  94.38 
 
 		 698 bp  1066    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0507177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0746    90.78 
 
 		 698 bp  868    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0855  insertion element protein  94.38 
 
 		 698 bp  1066    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0978  insertion element protein  94.38 
 
 		 698 bp  1066    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1570  insertion element protein  94.38 
 
 		 698 bp  1066    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54283  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1612  insertion element protein  94.38 
 
 		 698 bp  1066    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1815    94.66 
 
 		 1749 bp  1197    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.488582  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1816  insertion element protein  94.38 
 
 		 698 bp  1066    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.495778 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2200  insertion element protein  94.38 
 
 		 698 bp  1066    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2454  insertion element protein  94.38 
 
 		 698 bp  1066    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2713    94.66 
 
 		 3054 bp  1197    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2714  insertion element protein  94.38 
 
 		 698 bp  1066    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2872  insertion element protein  98.28 
 
 		 698 bp  1289    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0170965  normal  0.0593155 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2883  insertion element protein  94.38 
 
 		 698 bp  1066    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00013028  normal  0.0546907 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3170  insertion element protein  99 
 
 		 698 bp  1328    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3171  insertion element protein  91.21 
 
 		 698 bp  892    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.22651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3185  insertion element protein  91.21 
 
 		 698 bp  892    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3346  insertion element protein  94.24 
 
 		 698 bp  1059    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3632  insertion element protein  94.38 
 
 		 698 bp  1066    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00026173  normal  0.763989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3881  insertion element protein  94.38 
 
 		 698 bp  1066    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.719771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3893  insertion element protein  94.24 
 
 		 698 bp  1059    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0068  IS1 transposase orfB  98.61 
 
 		 504 bp  944    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518742 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0074  IS1 transposase orfB  99.01 
 
 		 504 bp  959    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>