More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2872 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_2872  insertion element protein  100 
 
 
232 aa  484  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0170965  normal  0.0593155 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3170  insertion element protein  98.71 
 
 
232 aa  481  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0270  insertion element protein  95.26 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0507177  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0855  insertion element protein  95.26 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0978  insertion element protein  95.26 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1570  insertion element protein  95.26 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54283  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1612  insertion element protein  95.26 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1816  insertion element protein  95.26 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.495778 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2200  insertion element protein  95.26 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209306  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2454  insertion element protein  95.26 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875494  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2714  insertion element protein  95.26 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2883  insertion element protein  95.26 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00013028  normal  0.0546907 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3346  insertion element protein  94.83 
 
 
232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3632  insertion element protein  95.26 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00026173  normal  0.763989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3881  insertion element protein  95.26 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.719771  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3893  insertion element protein  94.83 
 
 
232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3171  insertion element protein  93.1 
 
 
232 aa  460  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.22651  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3185  insertion element protein  93.1 
 
 
232 aa  460  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0774581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00237  IS1 protein InsB  99.33 
 
 
167 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02452  IS1 protein InsB  99.33 
 
 
167 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1163  IS1, transposase orfB  99.33 
 
 
167 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.452867  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02416  hypothetical protein  99.33 
 
 
167 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2655  IS1, transposase orfB  99.33 
 
 
167 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000283913  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1030  IS1 transposase orfB  99.33 
 
 
167 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.871892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00240  hypothetical protein  99.33 
 
 
167 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.909946  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2007  IS1 transposase orfB  99.33 
 
 
167 aa  308  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00024  IS1 protein InsB  99.33 
 
 
167 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00213822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00504  IS1 protein InsB  99.33 
 
 
167 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00545  IS1 protein insB  99.33 
 
 
167 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.160638  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01244  IS1 protein InsA  99.33 
 
 
167 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01373  IS1 protein InsB  99.33 
 
 
167 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01881  IS1 protein InsB  99.33 
 
 
167 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000653204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02143  IS1 protein InsB  99.33 
 
 
167 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04286  IS1 protein InsB  99.33 
 
 
167 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.448136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04179  hypothetical protein  99.33 
 
 
167 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00025  hypothetical protein  99.33 
 
 
167 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0086  IS1 transposase orfB  99.33 
 
 
167 aa  308  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0718475  hitchhiker  0.0000000542412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2996  IS1 transposase orfB  99.33 
 
 
167 aa  308  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.217077 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00534  hypothetical protein  99.33 
 
 
167 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00509  hypothetical protein  99.33 
 
 
167 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.584705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01385  hypothetical protein  99.33 
 
 
167 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01253  hypothetical protein  99.33 
 
 
167 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02102  hypothetical protein  99.33 
 
 
167 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01871  hypothetical protein  99.33 
 
 
167 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000392392  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00313  IS1 protein InsB  98.66 
 
 
167 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00340  IS1 protein InsB  98.66 
 
 
167 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00571  IS1 protein InsB  98.66 
 
 
167 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00587  IS1 protein InsB  98.66 
 
 
167 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01934  IS1 protein InsB  98.66 
 
 
167 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00317  hypothetical protein  98.66 
 
 
167 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00344  hypothetical protein  98.66 
 
 
167 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00576  hypothetical protein  98.66 
 
 
167 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00560  hypothetical protein  98.66 
 
 
167 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0218777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04142  hypothetical protein  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.972616  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01117  IS1 protein InsB  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02040  IS1 protein InsB  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04173  hypothetical protein  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02646  IS1 protein InsB  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02823  IS1 protein InsB  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000374053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03484  IS1 protein InsB  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04163  IS1 protein InsB  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.636696  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04180  IS1 protein InsB  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04209  IS1 protein InsB  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04281  IS1 protein InsB  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4691  hypothetical protein  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000333815  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0065  IS1, transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04125  hypothetical protein  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.64287  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03435  hypothetical protein  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01982  hypothetical protein  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2701  IS1, transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2761  IS1, transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000020143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0330  IS1, transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02607  hypothetical protein  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01998  hypothetical protein  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0068  IS1 transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518742 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0074  IS1 transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010878 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0104  IS1 transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00262405  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02772  hypothetical protein  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000838069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2252  IS1 transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.657122  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01124  hypothetical protein  98.66 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01921  hypothetical protein  97.99 
 
 
167 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02270  IS1 protein InsB  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03227  IS1 protein InsB  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4897  IS1 transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0780  IS1, transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1140  IS1, transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0049533  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1386  IS1, transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1779  IS1, transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2416  IS1, transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0295227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2650  IS1, transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0337075  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2785  IS1, transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000643973  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02478  hypothetical protein  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3007  IS1, transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000875521  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3091  IS1, transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3145  IS1, transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3240  IS1, transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.035564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3688  IS1, transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4905  IS1 transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251538  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2309  IS1 transposase orfB  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00216  hypothetical protein  98.66 
 
 
167 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>