289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3706 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1547    97.02 
 
 		 494 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0997  IS1 transposase orfB  99.01 
 
 		 504 bp  959    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000390214  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1722  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0802  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0975  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00027943  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00503    90.78 
 
 		 1860 bp  868    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.233499  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1705  IS1 transposase orfB  99.01 
 
 		 504 bp  959    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.426692  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1578  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0917  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00131212  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1484  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01115    90.49 
 
 		 1689 bp  852    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0749  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01242    90.78 
 
 		 2672 bp  868    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1729  IS1 transposase orfB  99.01 
 
 		 504 bp  959    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1572  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1332  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00400739  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1319  IS1 transposase orfB  99.01 
 
 		 504 bp  959    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.808236  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1626  IS1 transposase orfB  99.01 
 
 		 504 bp  959    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0818  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.449545  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02450    90.63 
 
 		 2195 bp  860    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1662    98.69 
 
 		 2712 bp  1007    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.87789  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1409  IS1 transposase orfB  99.36 
 
 		 495 bp  904    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02645    90.49 
 
 		 1425 bp  852    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1518  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.700974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1513  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000394756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03226    90.63 
 
 		 1863 bp  860    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1499  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03483    90.49 
 
 		 1673 bp  852    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0706  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.60614  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04161    100 
 
 		 396 bp  785    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0909  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00244451  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0651  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.332966  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1082  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04214    90.78 
 
 		 2201 bp  868    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.611997  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1065  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1621  IS1 transposase orfB  99.17 
 
 		 663 bp  928    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0271    90.63 
 
 		 698 bp  860    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2655    90.2 
 
 		 698 bp  837    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3331    90.2 
 
 		 698 bp  837    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.526792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3341    90.2 
 
 		 698 bp  837    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.720184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3576    90.49 
 
 		 698 bp  852    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000806307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3685    90.49 
 
 		 698 bp  852    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.406239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3706    100 
 
 		 698 bp  1384    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3780    90.49 
 
 		 698 bp  852    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0636  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.527887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0444  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000536612  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0048    97.95 
 
 		 504 bp  888    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0333  IS1, transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  967    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0134876  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0413  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1696  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0135936  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0534    99.14 
 
 		 2436 bp  1334    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2176  IS1, transposase orfB  97.82 
 
 		 498 bp  914    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0703398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2198  IS1, transposase orfB  91.67 
 
 		 504 bp  666    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0466  IS1 transposase orfB  99.01 
 
 		 504 bp  959    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.634009  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1712  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.674197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0558  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0604  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0560  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00131966  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0546  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0461  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0330  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183379  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0281  IS1 transposase orfB  91.2 
 
 		 504 bp  642    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0270  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0288  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.907717  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4872    99.4 
 
 		 504 bp  975    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4941    97.42 
 
 		 503 bp  888    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3802    90.22 
 
 		 698 bp  823    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0270  insertion element protein  94.7 
 
 		 698 bp  1090    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0507177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0746    99.43 
 
 		 698 bp  1352    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0855  insertion element protein  94.7 
 
 		 698 bp  1090    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0978  insertion element protein  94.7 
 
 		 698 bp  1090    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1570  insertion element protein  94.7 
 
 		 698 bp  1090    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54283  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1612  insertion element protein  94.7 
 
 		 698 bp  1090    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1815    94.7 
 
 		 1749 bp  1090    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.488582  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1816  insertion element protein  94.7 
 
 		 698 bp  1090    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.495778 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2200  insertion element protein  94.7 
 
 		 698 bp  1090    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2454  insertion element protein  94.7 
 
 		 698 bp  1090    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2713    94.7 
 
 		 3054 bp  1090    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2714  insertion element protein  94.7 
 
 		 698 bp  1090    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2872  insertion element protein  91.35 
 
 		 698 bp  900    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0170965  normal  0.0593155 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2883  insertion element protein  94.7 
 
 		 698 bp  1090    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00013028  normal  0.0546907 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3170  insertion element protein  90.2 
 
 		 698 bp  837    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3171  insertion element protein  98.71 
 
 		 698 bp  1312    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.22651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3185  insertion element protein  98.71 
 
 		 698 bp  1312    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3346  insertion element protein  94.56 
 
 		 698 bp  1082    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3632  insertion element protein  94.7 
 
 		 698 bp  1090    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00026173  normal  0.763989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3881  insertion element protein  94.7 
 
 		 698 bp  1090    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.719771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3893  insertion element protein  94.56 
 
 		 698 bp  1082    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1629  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0557  IS1 transposase orfB  94.47 
 
 		 504 bp  753    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1671  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0964  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0119708  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4757  IS1 transposase orfB  96.83 
 
 		 504 bp  872    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.279139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0014  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0676781  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0038  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0101  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0130  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000385847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0214  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.672743  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0221  IS1 transposase orfB  99.21 
 
 		 504 bp  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0260  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 		 504 bp  975    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>