More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0330 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0065  IS1, transposase orfB  100 
 
 
167 aa  348  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0330  IS1, transposase orfB  100 
 
 
167 aa  348  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00237  IS1 protein InsB  99.4 
 
 
167 aa  346  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02452  IS1 protein InsB  99.4 
 
 
167 aa  346  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1163  IS1, transposase orfB  99.4 
 
 
167 aa  346  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.452867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2655  IS1, transposase orfB  99.4 
 
 
167 aa  346  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000283913  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02416  hypothetical protein  99.4 
 
 
167 aa  346  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1030  IS1 transposase orfB  99.4 
 
 
167 aa  346  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.871892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00240  hypothetical protein  99.4 
 
 
167 aa  346  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.909946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00024  IS1 protein InsB  98.8 
 
 
167 aa  344  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00213822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00504  IS1 protein InsB  98.8 
 
 
167 aa  344  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00545  IS1 protein insB  98.8 
 
 
167 aa  344  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.160638  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01244  IS1 protein InsA  98.8 
 
 
167 aa  344  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01373  IS1 protein InsB  98.8 
 
 
167 aa  344  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01881  IS1 protein InsB  98.8 
 
 
167 aa  344  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000653204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02143  IS1 protein InsB  98.8 
 
 
167 aa  344  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04286  IS1 protein InsB  98.8 
 
 
167 aa  344  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.448136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02102  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  344  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01871  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  344  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000392392  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04179  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  344  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01385  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  344  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01253  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  344  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0086  IS1 transposase orfB  98.8 
 
 
167 aa  344  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0718475  hitchhiker  0.0000000542412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2996  IS1 transposase orfB  98.8 
 
 
167 aa  344  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.217077 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00025  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  344  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00534  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  344  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00509  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  344  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.584705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00313  IS1 protein InsB  98.2 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00340  IS1 protein InsB  98.2 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00571  IS1 protein InsB  98.2 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00587  IS1 protein InsB  98.2 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01117  IS1 protein InsB  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01934  IS1 protein InsB  98.2 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02040  IS1 protein InsB  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02646  IS1 protein InsB  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02823  IS1 protein InsB  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000374053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03484  IS1 protein InsB  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04163  IS1 protein InsB  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.636696  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04180  IS1 protein InsB  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04209  IS1 protein InsB  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04281  IS1 protein InsB  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4691  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000333815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2701  IS1, transposase orfB  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2761  IS1, transposase orfB  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000020143  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01998  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01982  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02607  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04125  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.64287  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04173  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03435  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02772  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000838069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04142  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.972616  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00317  hypothetical protein  98.2 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00344  hypothetical protein  98.2 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00560  hypothetical protein  98.2 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0218777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01124  hypothetical protein  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00576  hypothetical protein  98.2 
 
 
167 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01921  hypothetical protein  97.6 
 
 
167 aa  342  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00211  IS1 protein InsB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02270  IS1 protein InsB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02514  IS1 protein InsB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03227  IS1 protein InsB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0739  IS1, transposase orfB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00024765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0780  IS1, transposase orfB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1140  IS1, transposase orfB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0049533  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1386  IS1, transposase orfB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1530  IS1, transposase orfB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1651  IS1, transposase orfB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000315416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1779  IS1, transposase orfB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2416  IS1, transposase orfB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0295227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2650  IS1, transposase orfB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0337075  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2785  IS1, transposase orfB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000643973  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3007  IS1, transposase orfB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000875521  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3091  IS1, transposase orfB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3145  IS1, transposase orfB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3240  IS1, transposase orfB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.035564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3688  IS1, transposase orfB  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02231  hypothetical protein  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02478  hypothetical protein  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03179  hypothetical protein  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00216  hypothetical protein  98.2 
 
 
167 aa  342  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1900  IS1, transposase orfB  97.6 
 
 
167 aa  340  8e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2922  IS1, transposase orfB  97.6 
 
 
167 aa  340  8e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129263  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2309  IS1 transposase orfB  97.6 
 
 
167 aa  339  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3316  IS1, transposase orfB  97.6 
 
 
167 aa  338  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2007  IS1 transposase orfB  97.6 
 
 
167 aa  338  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0068  IS1 transposase orfB  97.01 
 
 
167 aa  337  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518742 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0074  IS1 transposase orfB  97.01 
 
 
167 aa  337  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010878 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0104  IS1 transposase orfB  97.01 
 
 
167 aa  337  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00262405  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2252  IS1 transposase orfB  97.01 
 
 
167 aa  337  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.657122  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4913  IS1, transposase orfB  95.81 
 
 
164 aa  329  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4905  IS1 transposase orfB  95.21 
 
 
167 aa  328  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251538  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2313  IS1 transposase orfB  92.81 
 
 
167 aa  327  5.0000000000000004e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0557  IS1 transposase orfB  93.41 
 
 
167 aa  327  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4897  IS1 transposase orfB  94.61 
 
 
167 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0281  IS1 transposase orfB  94.61 
 
 
167 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4868  IS1 transposase orfB  91.62 
 
 
167 aa  322  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409721  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2727  IS1 transposase orfB  91.62 
 
 
167 aa  322  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3100  IS1 transposase orfB  91.62 
 
 
167 aa  322  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327299  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1671  IS1 transposase orfB  91.62 
 
 
167 aa  322  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>