45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1145 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1145  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  100 
 
 		 94 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.274258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1554  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  98.94 
 
 		 94 aa  191  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2381  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  97.87 
 
 		 94 aa  191  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2229  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  98.94 
 
 		 94 aa  191  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.691967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02019  galactitol-specific enzyme IIB component of PTS  97.87 
 
 		 94 aa  189  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01985  hypothetical protein  97.87 
 
 		 94 aa  189  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3072  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  94.68 
 
 		 94 aa  188  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0971  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  94.68 
 
 		 94 aa  188  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3448  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  77.66 
 
 		 94 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.605443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3446  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  77.66 
 
 		 94 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3554  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  77.66 
 
 		 94 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.306895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3517  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  77.66 
 
 		 94 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3614  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  77.66 
 
 		 94 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.188912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1143  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  67.02 
 
 		 94 aa  142  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3387  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  57.14 
 
 		 92 aa  115  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000879799  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0231  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  37.36 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0237  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  37.36 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4064  putative PTS system transporter subunit IIB  37.23 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.801033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4009  putative IIB component of PTS system  37.23 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4114  PTS system IIB component  37.23 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3993  putative IIB component of PTS system  37.23 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.971949  normal  0.466757 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3158  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  39.36 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3768  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIB component  36.56 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0033  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  38.04 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4824  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIB component  35.48 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3751  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  38.46 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0215  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  37.23 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1729  PTS system lactose/cellobiose-specific transporter subunit IIB  33.7 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0436127  normal  0.448527 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04170  predicted enzyme IIB component of PTS  34.44 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3695  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  34.44 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04132  hypothetical protein  34.44 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1730  PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  33.7 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1727  PTS system lactose/cellobiose-specific transporter subunit IIB  33.7 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1791  PTS system Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  33.7 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00423056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1548  PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  33.7 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0122  response regulator receiver protein  29.35 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000835049  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4121  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  29.07 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1646  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  34.07 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317921 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0151  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  27.96 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1733  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  30.11 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0031  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  28.89 
 
 		 90 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2221  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  26.74 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0236  phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component  22.73 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09230  phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component  24.72 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3722  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  30 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000348098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>