36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1646 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_1646  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  100 
 
 		 97 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317921 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3256  PTS system galactitol-specific enzyme II, B component  80 
 
 		 57 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00410323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3387  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  39.13 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000879799  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3751  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  35.87 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1729  PTS system lactose/cellobiose-specific transporter subunit IIB  35.48 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0436127  normal  0.448527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1548  PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  34.41 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1730  PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  34.41 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1791  PTS system Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  34.41 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00423056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1727  PTS system lactose/cellobiose-specific transporter subunit IIB  34.41 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542593  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04170  predicted enzyme IIB component of PTS  34.41 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04132  hypothetical protein  34.41 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3695  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  34.41 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1143  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  39.08 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0151  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  34.78 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02019  galactitol-specific enzyme IIB component of PTS  36.26 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01985  hypothetical protein  36.26 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3554  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  35.87 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.306895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3448  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  35.87 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.605443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3446  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  35.87 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3517  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  35.87 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3614  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  35.87 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.188912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0033  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  34.07 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2229  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  35.16 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.691967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1554  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  35.16 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0971  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  34.78 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366549 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3072  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  34.78 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248985 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2381  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  34.07 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1145  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  34.07 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.274258  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3158  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  31.46 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09230  phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component  27.84 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1814  PTS system, IIB component  26.09 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3722  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  30.21 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000348098  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0231  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  29.79 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0237  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  29.79 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0215  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  31.37 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1524  transcriptional antiterminator, BglG  46.43 
 
 		 513 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000100792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>