12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2224 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2224  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0522  hypothetical protein  38.85 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0445  hypothetical protein  42.86 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1590  hypothetical protein  31.48 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1437  hypothetical protein  30.36 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5261  putative nutrient deprivation-induced protein  41.38 
 
 		 174 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5620  nutrient deprivation-induced protein  38.98 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.188949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1246  hypothetical protein  26.54 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.96129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4600  hypothetical protein  27.12 
 
 		 226 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3901  putative nutrient deprivation-induced protein  38.6 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0076342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1394  protein of unknown function DUF883, ElaB  31.37 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0974  hypothetical protein  34.18 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>