24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1246 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1246  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.96129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3870  hypothetical protein  86.1 
 
 		 193 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1437  hypothetical protein  63 
 
 		 201 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4600  hypothetical protein  52.87 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3877  hypothetical protein  40.82 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.65728  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1590  hypothetical protein  36.11 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5620  nutrient deprivation-induced protein  30.38 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.188949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2209  hypothetical protein  36.96 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3901  putative nutrient deprivation-induced protein  25.95 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0076342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1890  hypothetical protein  29.14 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198993  normal  0.263548 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5261  putative nutrient deprivation-induced protein  29.41 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6050  hypothetical protein  29.32 
 
 		 274 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0160776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1046  hypothetical protein  29.32 
 
 		 274 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0293448  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2074  hypothetical protein  40.26 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3141  hypothetical protein  29.23 
 
 		 173 aa  51.6  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1322  hypothetical protein  28.4 
 
 		 277 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2224  hypothetical protein  26.54 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4233  hypothetical protein  31.82 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4348  hypothetical protein  26.97 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.915436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0562  hypothetical protein  28.49 
 
 		 336 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1484  hypothetical protein  29.21 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000292957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7552  hypothetical protein  26.06 
 
 		 173 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0606564  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2260  hypothetical protein  34.74 
 
 		 173 aa  41.6  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4180  hypothetical protein  29.23 
 
 		 171 aa  41.6  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>