19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5620 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5620  nutrient deprivation-induced protein  100 
 
 
189 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.188949 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5261  putative nutrient deprivation-induced protein  59.48 
 
 
174 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3901  putative nutrient deprivation-induced protein  52.08 
 
 
190 aa  136  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0076342  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3870  hypothetical protein  36.45 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679069  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4600  hypothetical protein  32.28 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1590  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1246  hypothetical protein  30.38 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.96129  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1437  hypothetical protein  31.25 
 
 
201 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2074  hypothetical protein  31.97 
 
 
182 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2209  hypothetical protein  38.82 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510587  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2224  hypothetical protein  38.98 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0348  hypothetical protein  31.15 
 
 
319 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4348  hypothetical protein  30.34 
 
 
197 aa  45.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.915436  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3877  hypothetical protein  28.4 
 
 
178 aa  44.7  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.65728  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4180  hypothetical protein  42.11 
 
 
171 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1890  hypothetical protein  26.83 
 
 
321 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198993  normal  0.263548 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1046  hypothetical protein  23.08 
 
 
274 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0293448  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0522  hypothetical protein  28.92 
 
 
196 aa  42  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6050  hypothetical protein  23.08 
 
 
274 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0160776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>