17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3901 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3901  putative nutrient deprivation-induced protein  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0076342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5620  nutrient deprivation-induced protein  52.08 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.188949 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5261  putative nutrient deprivation-induced protein  48.92 
 
 		 174 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1246  hypothetical protein  25.95 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.96129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1590  hypothetical protein  36.17 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1437  hypothetical protein  29.31 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6050  hypothetical protein  30.16 
 
 		 274 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0160776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1046  hypothetical protein  29.23 
 
 		 274 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0293448  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3870  hypothetical protein  26.35 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1890  hypothetical protein  29.22 
 
 		 321 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198993  normal  0.263548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2074  hypothetical protein  31.47 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4600  hypothetical protein  26.05 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0348  hypothetical protein  30.57 
 
 		 319 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2209  hypothetical protein  35.16 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2224  hypothetical protein  38.6 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3877  hypothetical protein  32.35 
 
 		 178 aa  42  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.65728  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0974  hypothetical protein  35.45 
 
 		 146 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>