38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1447 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1447  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.802365  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1482  hypothetical protein  85.2 
 
 
222 aa  333  9e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265042  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4531  hypothetical protein  48.8 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5195  hypothetical protein  46.52 
 
 
218 aa  144  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1319  hypothetical protein  47.73 
 
 
237 aa  141  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268962  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1704  hypothetical protein  45.93 
 
 
237 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0196548  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2879  hypothetical protein  37.86 
 
 
287 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1934  hypothetical protein  42.86 
 
 
240 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16130  hypothetical protein  44.16 
 
 
248 aa  134  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.173695  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1638  hypothetical protein  42.22 
 
 
254 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241608  normal  0.234599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1637  hypothetical protein  39.81 
 
 
234 aa  132  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0702589  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24250  hypothetical protein  42.13 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0996351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2289  hypothetical protein  38.32 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6763  hypothetical protein  40.38 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1872  hypothetical protein  42.11 
 
 
237 aa  125  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14510  hypothetical protein  43.09 
 
 
277 aa  123  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1409  hypothetical protein  40.49 
 
 
233 aa  118  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13110  hypothetical protein  39.29 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000366474  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1516  hypothetical protein  38.39 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0259  hypothetical protein  37.57 
 
 
284 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.896215  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1921  hypothetical protein  39.01 
 
 
249 aa  116  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152276  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15780  hypothetical protein  37.16 
 
 
293 aa  115  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.092559  normal  0.257076 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1630  hypothetical protein  36.67 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000157695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1525  hypothetical protein  42.94 
 
 
283 aa  111  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.154932  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1938  hypothetical protein  39.11 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2907  hypothetical protein  39.9 
 
 
213 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.874277  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1401  hypothetical protein  47.76 
 
 
229 aa  105  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1706  hypothetical protein  34.15 
 
 
278 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000919606  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0491  hypothetical protein  31.8 
 
 
254 aa  100  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.170579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2252  hypothetical protein  38.82 
 
 
305 aa  95.5  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2238  hypothetical protein  35.41 
 
 
251 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0527532  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2181  hypothetical protein  35.41 
 
 
251 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2192  hypothetical protein  35.41 
 
 
251 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1558  hypothetical protein  42.69 
 
 
275 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1885  hypothetical protein  34.7 
 
 
274 aa  87.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2468  hypothetical protein  36.54 
 
 
243 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3932  hypothetical protein  36.08 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.202092  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12711  hypothetical protein  36.18 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0221261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>