38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1525 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1525  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  541  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.154932  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1319  hypothetical protein  43.98 
 
 		 237 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268962  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5195  hypothetical protein  43.08 
 
 		 218 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1872  hypothetical protein  43.1 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1482  hypothetical protein  43.37 
 
 		 222 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4531  hypothetical protein  39.76 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16130  hypothetical protein  37.5 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.173695  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1447  hypothetical protein  42.77 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.802365  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1921  hypothetical protein  37.95 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152276  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1704  hypothetical protein  39.77 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0196548  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14510  hypothetical protein  36.17 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1638  hypothetical protein  36.84 
 
 		 254 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241608  normal  0.234599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2289  hypothetical protein  42.69 
 
 		 227 aa  96.3  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15780  hypothetical protein  38.07 
 
 		 293 aa  94  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.092559  normal  0.257076 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24250  hypothetical protein  36.31 
 
 		 240 aa  92.8  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0996351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1706  hypothetical protein  30.63 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000919606  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1637  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0702589  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0491  hypothetical protein  29.71 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.170579 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0259  hypothetical protein  32.75 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.896215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2879  hypothetical protein  32.79 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1516  hypothetical protein  28.99 
 
 		 207 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1934  hypothetical protein  32.78 
 
 		 240 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1630  hypothetical protein  34.39 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000157695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6763  hypothetical protein  37.28 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1938  hypothetical protein  37.14 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2907  hypothetical protein  34.62 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.874277  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13110  hypothetical protein  34.59 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000366474  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1409  hypothetical protein  34.29 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1558  hypothetical protein  40 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2181  hypothetical protein  28.87 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2238  hypothetical protein  28.87 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0527532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2192  hypothetical protein  28.87 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12711  hypothetical protein  29.94 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0221261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1401  hypothetical protein  35.09 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3932  hypothetical protein  29.94 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.202092  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2468  hypothetical protein  27.92 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2252  hypothetical protein  30.68 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1885  hypothetical protein  29.05 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>