38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1409 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1409  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  464  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1921  hypothetical protein  50.6 
 
 
249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152276  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16130  hypothetical protein  50 
 
 
248 aa  228  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.173695  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1704  hypothetical protein  51.45 
 
 
237 aa  206  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0196548  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1637  hypothetical protein  47.58 
 
 
234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0702589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1938  hypothetical protein  49.8 
 
 
244 aa  194  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1630  hypothetical protein  47.66 
 
 
240 aa  192  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000157695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1638  hypothetical protein  45.02 
 
 
254 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241608  normal  0.234599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14510  hypothetical protein  44.14 
 
 
277 aa  169  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1558  hypothetical protein  53.4 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2289  hypothetical protein  40.17 
 
 
227 aa  158  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1934  hypothetical protein  46.19 
 
 
240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6763  hypothetical protein  44.44 
 
 
224 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1706  hypothetical protein  42.02 
 
 
278 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000919606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2879  hypothetical protein  40.39 
 
 
287 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13110  hypothetical protein  46.5 
 
 
258 aa  145  6e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000366474  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15780  hypothetical protein  43.26 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.092559  normal  0.257076 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0259  hypothetical protein  41.85 
 
 
284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.896215  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1482  hypothetical protein  39.53 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265042  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1447  hypothetical protein  39.51 
 
 
223 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.802365  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1872  hypothetical protein  40 
 
 
237 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4531  hypothetical protein  37.44 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1319  hypothetical protein  36.33 
 
 
237 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268962  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5195  hypothetical protein  38.89 
 
 
218 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2907  hypothetical protein  37.86 
 
 
213 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.874277  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1401  hypothetical protein  44.58 
 
 
229 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0491  hypothetical protein  37.43 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.170579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24250  hypothetical protein  33.71 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0996351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2252  hypothetical protein  36.52 
 
 
305 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1885  hypothetical protein  34.67 
 
 
274 aa  85.9  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1516  hypothetical protein  35.29 
 
 
207 aa  85.1  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1525  hypothetical protein  35.85 
 
 
283 aa  78.6  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.154932  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3932  hypothetical protein  31.65 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.202092  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2468  hypothetical protein  32.28 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2181  hypothetical protein  30.81 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2238  hypothetical protein  30.81 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0527532  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2192  hypothetical protein  30.81 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12711  hypothetical protein  30 
 
 
259 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0221261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>