24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1007 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1007  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  252  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0447393  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1117  hypothetical protein  88.8 
 
 		 130 aa  220  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1570  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  58.18 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1928  hypothetical protein  49.09 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2135  hypothetical protein  39.58 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1352  hypothetical protein  43.68 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.688346  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4057  hypothetical protein  46.05 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.373959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2292  hypothetical protein  46.75 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0993  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.83 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1149  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00416139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2566  hypothetical protein  37.08 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4294  hypothetical protein  38.89 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871194  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2185  putative cobalt transport protein  32.77 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00209489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2047  hypothetical protein  41.67 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.977545 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2110  hypothetical protein  41.67 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2064  hypothetical protein  41.67 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0078797  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.37 
 
 		 343 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1043  hypothetical protein  32.67 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0565  cobalt transport protein CbiN  35.53 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0744  putative cobalt transport protein  30.17 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0773  hypothetical protein  29.31 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0303299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1328  hypothetical protein  36.36 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455652  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.33 
 
 		 328 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0061  ABC-type transport system, permease component  38.2 
 
 		 301 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.43136e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>