25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2135 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2135  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  275  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  58.21 
 
 		 343 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0993  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  52.81 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1149  hypothetical protein  48.1 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00416139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1352  hypothetical protein  53.97 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.688346  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1117  hypothetical protein  37.7 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4294  hypothetical protein  53.85 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871194  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2566  hypothetical protein  45.57 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1007  hypothetical protein  39 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0447393  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0744  putative cobalt transport protein  35.48 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0773  hypothetical protein  35.48 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0303299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1928  hypothetical protein  32.26 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2185  putative cobalt transport protein  36.73 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00209489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1570  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.21 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.13 
 
 		 307 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0061  ABC-type transport system, permease component  40.51 
 
 		 301 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.43136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.24 
 
 		 306 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.57 
 
 		 328 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0712  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  51.22 
 
 		 332 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.218257  hitchhiker  0.00000357899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0565  cobalt transport protein CbiN  34.78 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2047  hypothetical protein  36 
 
 		 111 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.977545 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2110  hypothetical protein  36 
 
 		 111 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2064  hypothetical protein  36 
 
 		 111 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0078797  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2352  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.93 
 
 		 310 aa  40  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>