17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1043 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1043  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  243  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2185  putative cobalt transport protein  70.71 
 
 
114 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00209489 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0773  hypothetical protein  66.02 
 
 
114 aa  146  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0303299  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0744  putative cobalt transport protein  65.05 
 
 
114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1149  hypothetical protein  37.89 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00416139  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2566  hypothetical protein  42.86 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4294  hypothetical protein  43.24 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871194  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  43.94 
 
 
326 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  41.03 
 
 
306 aa  48.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.1 
 
 
307 aa  47  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  40.24 
 
 
328 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0061  ABC-type transport system, permease component  34.78 
 
 
301 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.43136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2135  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1928  hypothetical protein  31.43 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1792  cobalt transport protein CbiN  29.7 
 
 
98 aa  41.6  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000072815  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  43.55 
 
 
343 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1117  hypothetical protein  33.04 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.863863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>