22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1117 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1117  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  253  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1007  hypothetical protein  88.8 
 
 		 130 aa  207  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0447393  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1570  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  57.27 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1928  hypothetical protein  49.09 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4057  hypothetical protein  45.13 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.373959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2135  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1352  hypothetical protein  41.38 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.688346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2292  hypothetical protein  46.75 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0993  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.22 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1149  hypothetical protein  31.43 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00416139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2566  hypothetical protein  41.77 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4294  hypothetical protein  39.13 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871194  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2064  hypothetical protein  47.69 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0078797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2110  hypothetical protein  47.69 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2047  hypothetical protein  47.69 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.977545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.53 
 
 		 343 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2185  putative cobalt transport protein  32.77 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00209489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0744  putative cobalt transport protein  33 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0773  hypothetical protein  32 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0303299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1328  hypothetical protein  37 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455652  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0565  cobalt transport protein CbiN  32.89 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1043  hypothetical protein  33.04 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.16619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>