27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1928 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1928  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  266  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4057  hypothetical protein  62.62 
 
 		 123 aa  114  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.373959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2292  hypothetical protein  60.71 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2064  hypothetical protein  56.48 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0078797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2110  hypothetical protein  56.48 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2047  hypothetical protein  56.48 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.977545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1117  hypothetical protein  49.09 
 
 		 130 aa  87.4  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1570  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  43.64 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1007  hypothetical protein  49.09 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0447393  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0993  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.42 
 
 		 344 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1352  hypothetical protein  35.23 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.688346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  42.28 
 
 		 343 aa  50.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1149  hypothetical protein  32.41 
 
 		 101 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00416139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2135  hypothetical protein  34.34 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1328  hypothetical protein  33.64 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455652  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0486  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.62 
 
 		 337 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2185  putative cobalt transport protein  32.71 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00209489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0744  putative cobalt transport protein  31.36 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0773  hypothetical protein  31.36 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0303299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1043  hypothetical protein  31.43 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1182  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.21 
 
 		 331 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00505251  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0089  cobalt transport protein CbiN  28.7 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  45.24 
 
 		 352 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1479  cobalt transport protein CbiN  27.83 
 
 		 113 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2005  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  43.86 
 
 		 343 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0387041  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0492  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.43 
 
 		 337 aa  40.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.267913  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1792  cobalt transport protein CbiN  28.28 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000072815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>