22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1570 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1570  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  100 
 
 		 117 aa  230  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1117  hypothetical protein  57.27 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1007  hypothetical protein  58.18 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0447393  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1928  hypothetical protein  43.64 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4057  hypothetical protein  57.53 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.373959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2292  hypothetical protein  51.32 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2064  hypothetical protein  45.83 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0078797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2110  hypothetical protein  45.83 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2047  hypothetical protein  45.83 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.977545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0993  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.14 
 
 		 344 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1352  hypothetical protein  35.63 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.688346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2135  hypothetical protein  34.38 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1149  hypothetical protein  29.81 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00416139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.5 
 
 		 343 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4294  hypothetical protein  32.58 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871194  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2185  putative cobalt transport protein  35.14 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00209489 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2441  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.33 
 
 		 346 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1328  hypothetical protein  32.11 
 
 		 91 aa  43.5  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2566  hypothetical protein  31.46 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102771  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1479  cobalt transport protein CbiN  31.82 
 
 		 113 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0744  putative cobalt transport protein  33.68 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0773  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0303299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>