25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1352 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1352  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  221  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.688346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  55.88 
 
 		 343 aa  90.9  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2135  hypothetical protein  55.56 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0993  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  54.44 
 
 		 344 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1117  hypothetical protein  41.22 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1007  hypothetical protein  43.44 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0447393  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1149  hypothetical protein  39.78 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00416139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1928  hypothetical protein  38.68 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1570  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.78 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4294  hypothetical protein  46.05 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871194  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2566  hypothetical protein  40.51 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1328  hypothetical protein  41.86 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455652  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4057  hypothetical protein  36.04 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.373959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  40.96 
 
 		 306 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0565  cobalt transport protein CbiN  32.58 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2185  putative cobalt transport protein  35.92 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00209489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0744  putative cobalt transport protein  38.04 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2292  hypothetical protein  40.28 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0773  hypothetical protein  38.04 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0303299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1792  cobalt transport protein CbiN  32.35 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000072815  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0712  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  51.22 
 
 		 332 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.218257  hitchhiker  0.00000357899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1043  hypothetical protein  34.02 
 
 		 121 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  43.94 
 
 		 328 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.76 
 
 		 307 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0032  cobalt transport protein CbiN  32.29 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>