17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4057 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4057  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  243  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.373959  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2292  hypothetical protein  71.9 
 
 
122 aa  147  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.347777 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1928  hypothetical protein  62.62 
 
 
134 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2064  hypothetical protein  62.5 
 
 
111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0078797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2110  hypothetical protein  62.5 
 
 
111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2047  hypothetical protein  62.5 
 
 
111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.977545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1117  hypothetical protein  50.44 
 
 
130 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1570  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  51.11 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1007  hypothetical protein  47.22 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0447393  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  43.3 
 
 
343 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0993  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.83 
 
 
344 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1352  hypothetical protein  36.36 
 
 
114 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.688346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2135  hypothetical protein  40.22 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1149  hypothetical protein  36.04 
 
 
101 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00416139  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1328  hypothetical protein  31.03 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455652  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0565  cobalt transport protein CbiN  34.51 
 
 
101 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0089  cobalt transport protein CbiN  38.46 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>